Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cav1P49817 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cav1P49817 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cav1P49817 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cav1P49817 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cav1P49817 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cav1P49817 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cav1P49817 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cav1P49817 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cav1P49817 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cav1P49817 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cav1P49817 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cav1P49817 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cav1P49817 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cav1P49817 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cav1P49817 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cav1P49817 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cav1P49817 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cav1P49817 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cav1P49817 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cav1P49817 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cav1P49817 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cav1P49817 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cav1P49817 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cav1P49817 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cav1P49817 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cav1P49817 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cav1P49817 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cav1P49817 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cav1P49817 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cav1P49817 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cav1P49817 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cav1P49817 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cav1P49817 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cav1P49817 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cav1P49817 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cav1P49817 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cav1P49817 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cav1P49817 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cav1P49817 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cav1P49817 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cav1P49817 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cav1P49817 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cav1P49817 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cav1P49817 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cav1P49817 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cav1P49817 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cav1P49817 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cav1P49817 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cav1P49817 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cav1P49817 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cav1P49817 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cav1P49817 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cav1P49817 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cav1P49817 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cav1P49817 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cav1P49817 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cav1P49817 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cav1P49817 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cav1P49817 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cav1P49817 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms