Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CitP49025 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CitP49025 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CitP49025 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CitP49025 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CitP49025 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CitP49025 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CitP49025 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CitP49025 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CitP49025 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CitP49025 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CitP49025 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CitP49025 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CitP49025 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CitP49025 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CitP49025 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CitP49025 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CitP49025 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CitP49025 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CitP49025 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CitP49025 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CitP49025 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CitP49025 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CitP49025 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CitP49025 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CitP49025 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CitP49025 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CitP49025 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CitP49025 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CitP49025 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CitP49025 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CitP49025 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CitP49025 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CitP49025 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CitP49025 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CitP49025 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CitP49025 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CitP49025 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CitP49025 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CitP49025 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CitP49025 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CitP49025 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CitP49025 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CitP49025 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CitP49025 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CitP49025 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CitP49025 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CitP49025 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CitP49025 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CitP49025 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CitP49025 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CitP49025 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CitP49025 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CitP49025 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CitP49025 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CitP49025 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CitP49025 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CitP49025 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CitP49025 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CitP49025 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CitP49025 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CitP49025 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CitP49025 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CitP49025 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CitP49025 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CitP49025 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CitP49025 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CitP49025 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CitP49025 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CitP49025 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CitP49025 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CitP49025 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CitP49025 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CitP49025 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CitP49025 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CitP49025 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CitP49025 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CitP49025 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CitP49025 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CitP49025 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CitP49025 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CitP49025 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CitP49025 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CitP49025 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CitP49025 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CitP49025 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CitP49025 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CitP49025 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CitP49025 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CitP49025 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CitP49025 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CitP49025 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CitP49025 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CitP49025 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CitP49025 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CitP49025 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CitP49025 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CitP49025 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CitP49025 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CitP49025 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms