Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms