Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfx2P48379 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms