Protein–RNA interactions for Protein: P48299

Edn3, Endothelin-3, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn3P48299 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Edn3P48299 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Edn3P48299 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Edn3P48299 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Edn3P48299 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Edn3P48299 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Edn3P48299 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Edn3P48299 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Edn3P48299 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Edn3P48299 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Edn3P48299 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Edn3P48299 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Edn3P48299 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Edn3P48299 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Edn3P48299 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Edn3P48299 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Edn3P48299 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Edn3P48299 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Edn3P48299 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Edn3P48299 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Edn3P48299 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Edn3P48299 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Edn3P48299 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms