Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbx2P48031 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx2P48031 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gbx2P48031 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx2P48031 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx2P48031 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx2P48031 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx2P48031 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx2P48031 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gbx2P48031 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx2P48031 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx2P48031 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx2P48031 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx2P48031 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx2P48031 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx2P48031 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx2P48031 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx2P48031 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx2P48031 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx2P48031 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gbx2P48031 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx2P48031 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx2P48031 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx2P48031 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx2P48031 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gbx2P48031 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gbx2P48031 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx2P48031 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx2P48031 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx2P48031 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx2P48031 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx2P48031 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx2P48031 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx2P48031 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx2P48031 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx2P48031 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx2P48031 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx2P48031 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx2P48031 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx2P48031 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbx2P48031 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbx2P48031 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbx2P48031 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbx2P48031 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gbx2P48031 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbx2P48031 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbx2P48031 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gbx2P48031 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gbx2P48031 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gbx2P48031 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbx2P48031 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbx2P48031 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gbx2P48031 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbx2P48031 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gbx2P48031 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gbx2P48031 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gbx2P48031 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbx2P48031 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gbx2P48031 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gbx2P48031 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbx2P48031 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gbx2P48031 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbx2P48031 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbx2P48031 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbx2P48031 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbx2P48031 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbx2P48031 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbx2P48031 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbx2P48031 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbx2P48031 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbx2P48031 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbx2P48031 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gbx2P48031 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbx2P48031 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbx2P48031 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbx2P48031 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Gbx2P48031 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbx2P48031 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbx2P48031 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gbx2P48031 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbx2P48031 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gbx2P48031 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms