Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms