Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms