Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms