Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgavP43406 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgavP43406 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgavP43406 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ItgavP43406 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ItgavP43406 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ItgavP43406 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ItgavP43406 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ItgavP43406 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ItgavP43406 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ItgavP43406 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ItgavP43406 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms