Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Tnfsf9P41274 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms