Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ThpoP40226 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ThpoP40226 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ThpoP40226 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ThpoP40226 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ThpoP40226 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ThpoP40226 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ThpoP40226 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ThpoP40226 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ThpoP40226 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ThpoP40226 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms