Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Chd1P40201 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chd1P40201 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chd1P40201 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chd1P40201 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chd1P40201 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chd1P40201 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd1P40201 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd1P40201 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd1P40201 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms