Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtprkP35822 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PtprkP35822 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtprkP35822 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprkP35822 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprkP35822 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprkP35822 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprkP35822 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprkP35822 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PtprkP35822 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtprkP35822 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtprkP35822 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprkP35822 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprkP35822 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PtprkP35822 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
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