Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms