Protein–RNA interactions for Protein: P33610

Prim2, DNA primase large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim2P33610 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim2P33610 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim2P33610 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim2P33610 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim2P33610 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim2P33610 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prim2P33610 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prim2P33610 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prim2P33610 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prim2P33610 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prim2P33610 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prim2P33610 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prim2P33610 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prim2P33610 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prim2P33610 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prim2P33610 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prim2P33610 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prim2P33610 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prim2P33610 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prim2P33610 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prim2P33610 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prim2P33610 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prim2P33610 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prim2P33610 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prim2P33610 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prim2P33610 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prim2P33610 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prim2P33610 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prim2P33610 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prim2P33610 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms