Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp13P33435 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms