Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms