Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms