Protein–RNA interactions for Protein: P31240

Pdgfb, Platelet-derived growth factor subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfbP31240 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms