Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VtnP29788 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VtnP29788 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VtnP29788 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VtnP29788 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VtnP29788 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VtnP29788 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
VtnP29788 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VtnP29788 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
VtnP29788 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VtnP29788 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VtnP29788 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VtnP29788 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VtnP29788 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VtnP29788 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VtnP29788 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VtnP29788 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VtnP29788 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
VtnP29788 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VtnP29788 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VtnP29788 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VtnP29788 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VtnP29788 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VtnP29788 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VtnP29788 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VtnP29788 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VtnP29788 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
VtnP29788 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VtnP29788 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VtnP29788 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VtnP29788 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VtnP29788 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VtnP29788 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VtnP29788 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VtnP29788 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VtnP29788 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VtnP29788 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VtnP29788 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VtnP29788 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VtnP29788 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VtnP29788 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VtnP29788 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VtnP29788 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VtnP29788 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VtnP29788 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VtnP29788 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VtnP29788 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
VtnP29788 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VtnP29788 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VtnP29788 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VtnP29788 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
VtnP29788 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VtnP29788 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VtnP29788 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VtnP29788 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VtnP29788 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VtnP29788 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VtnP29788 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VtnP29788 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VtnP29788 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VtnP29788 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VtnP29788 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VtnP29788 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VtnP29788 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
VtnP29788 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VtnP29788 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VtnP29788 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VtnP29788 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VtnP29788 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VtnP29788 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VtnP29788 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VtnP29788 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
VtnP29788 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VtnP29788 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VtnP29788 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VtnP29788 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VtnP29788 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
VtnP29788 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VtnP29788 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VtnP29788 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VtnP29788 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VtnP29788 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VtnP29788 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
VtnP29788 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VtnP29788 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VtnP29788 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VtnP29788 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VtnP29788 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VtnP29788 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VtnP29788 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VtnP29788 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VtnP29788 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VtnP29788 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VtnP29788 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
VtnP29788 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VtnP29788 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VtnP29788 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VtnP29788 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VtnP29788 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VtnP29788 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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