Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Casp1P29452 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Casp1P29452 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Casp1P29452 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Casp1P29452 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Casp1P29452 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Casp1P29452 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Casp1P29452 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Casp1P29452 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Casp1P29452 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms