Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms