Protein–RNA interactions for Protein: P28660

Nckap1, Nck-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap1P28660 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nckap1P28660 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nckap1P28660 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nckap1P28660 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms