Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms