Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms