Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms