Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms