Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
U2af2P26369 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
U2af2P26369 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
U2af2P26369 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
U2af2P26369 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
U2af2P26369 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
U2af2P26369 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms