Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdk11bP24788 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms