Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms