Protein–RNA interactions for Protein: P21275

Bmp4, Bone morphogenetic protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp4P21275 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms