Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ms4a2P20490 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ms4a2P20490 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ms4a2P20490 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ms4a2P20490 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ms4a2P20490 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms