Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VimP20152 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VimP20152 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VimP20152 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VimP20152 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VimP20152 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VimP20152 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VimP20152 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VimP20152 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VimP20152 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VimP20152 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VimP20152 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VimP20152 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VimP20152 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VimP20152 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VimP20152 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VimP20152 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VimP20152 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VimP20152 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VimP20152 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VimP20152 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VimP20152 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VimP20152 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VimP20152 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VimP20152 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VimP20152 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
VimP20152 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VimP20152 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VimP20152 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VimP20152 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VimP20152 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VimP20152 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VimP20152 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VimP20152 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VimP20152 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VimP20152 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VimP20152 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VimP20152 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VimP20152 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VimP20152 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VimP20152 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VimP20152 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VimP20152 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VimP20152 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VimP20152 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VimP20152 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VimP20152 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VimP20152 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VimP20152 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VimP20152 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VimP20152 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VimP20152 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VimP20152 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VimP20152 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VimP20152 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VimP20152 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VimP20152 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VimP20152 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VimP20152 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VimP20152 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VimP20152 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VimP20152 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VimP20152 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VimP20152 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VimP20152 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VimP20152 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VimP20152 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VimP20152 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VimP20152 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VimP20152 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VimP20152 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VimP20152 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VimP20152 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VimP20152 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VimP20152 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VimP20152 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VimP20152 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VimP20152 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VimP20152 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VimP20152 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VimP20152 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VimP20152 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VimP20152 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VimP20152 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VimP20152 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VimP20152 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VimP20152 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VimP20152 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VimP20152 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VimP20152 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VimP20152 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VimP20152 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VimP20152 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VimP20152 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VimP20152 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VimP20152 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VimP20152 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VimP20152 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VimP20152 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VimP20152 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms