Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18530 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18530 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18530 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18530 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18530 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18530 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18530 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18530 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18530 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18530 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18530 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18530 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18530 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18530 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18530 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18530 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18530 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18530 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18530 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18530 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18530 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18530 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18530 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18530 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18530 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18530 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18530 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18530 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18530 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18530 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18530 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18530 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18530 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18530 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18530 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18530 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18530 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18530 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18530 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18530 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18530 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18530 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18530 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18530 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18530 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18530 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18530 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18530 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18530 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18530 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18530 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18530 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18530 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18530 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18530 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18530 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18530 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18530 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18530 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18530 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18530 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P18530 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18530 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18530 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18530 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18530 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18530 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18530 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18530 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18530 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18530 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18530 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18530 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18530 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18530 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18530 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18530 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18530 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18530 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18530 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18530 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18530 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18530 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18530 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18530 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18530 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18530 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18530 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18530 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18530 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18530 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18530 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18530 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P18530 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18530 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18530 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18530 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18530 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18530 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms