Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata1P17679 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata1P17679 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata1P17679 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata1P17679 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata1P17679 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms