Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Defa-rs1P17533 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Defa-rs1P17533 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Defa-rs1P17533 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Defa-rs1P17533 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Defa-rs1P17533 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Defa-rs1P17533 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Defa-rs1P17533 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms