Protein–RNA interactions for Protein: P15508

Sptb, Spectrin beta chain, erythrocytic, mousemouse

Predictions only

Length 2,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptbP15508 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SptbP15508 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SptbP15508 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SptbP15508 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SptbP15508 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SptbP15508 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SptbP15508 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SptbP15508 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SptbP15508 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SptbP15508 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SptbP15508 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SptbP15508 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SptbP15508 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SptbP15508 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SptbP15508 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SptbP15508 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SptbP15508 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SptbP15508 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SptbP15508 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SptbP15508 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SptbP15508 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SptbP15508 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
SptbP15508 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SptbP15508 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SptbP15508 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SptbP15508 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SptbP15508 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SptbP15508 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SptbP15508 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SptbP15508 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SptbP15508 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SptbP15508 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SptbP15508 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SptbP15508 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SptbP15508 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SptbP15508 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SptbP15508 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SptbP15508 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SptbP15508 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SptbP15508 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SptbP15508 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SptbP15508 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SptbP15508 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SptbP15508 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
SptbP15508 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SptbP15508 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SptbP15508 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SptbP15508 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SptbP15508 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SptbP15508 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SptbP15508 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SptbP15508 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SptbP15508 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SptbP15508 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SptbP15508 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SptbP15508 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SptbP15508 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SptbP15508 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SptbP15508 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SptbP15508 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SptbP15508 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
SptbP15508 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SptbP15508 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SptbP15508 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SptbP15508 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SptbP15508 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SptbP15508 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SptbP15508 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SptbP15508 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SptbP15508 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SptbP15508 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SptbP15508 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SptbP15508 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SptbP15508 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SptbP15508 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SptbP15508 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SptbP15508 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SptbP15508 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SptbP15508 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SptbP15508 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SptbP15508 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SptbP15508 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SptbP15508 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SptbP15508 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SptbP15508 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SptbP15508 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SptbP15508 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SptbP15508 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SptbP15508 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SptbP15508 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SptbP15508 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SptbP15508 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SptbP15508 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SptbP15508 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SptbP15508 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SptbP15508 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
SptbP15508 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SptbP15508 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SptbP15508 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SptbP15508 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms