Protein–RNA interactions for Protein: P13405

Rb1, Retinoblastoma-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1P13405 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rb1P13405 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rb1P13405 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rb1P13405 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rb1P13405 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rb1P13405 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rb1P13405 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rb1P13405 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rb1P13405 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rb1P13405 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rb1P13405 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rb1P13405 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rb1P13405 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms