Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms