Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calb1P12658 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calb1P12658 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calb1P12658 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calb1P12658 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calb1P12658 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calb1P12658 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Calb1P12658 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Calb1P12658 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Calb1P12658 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Calb1P12658 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Calb1P12658 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Calb1P12658 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms