Protein–RNA interactions for Protein: P12032

Timp1, Metalloproteinase inhibitor 1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp1P12032 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Timp1P12032 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Timp1P12032 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timp1P12032 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timp1P12032 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Timp1P12032 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Timp1P12032 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timp1P12032 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timp1P12032 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timp1P12032 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timp1P12032 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timp1P12032 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timp1P12032 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timp1P12032 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Timp1P12032 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timp1P12032 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Timp1P12032 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timp1P12032 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timp1P12032 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timp1P12032 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timp1P12032 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Timp1P12032 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timp1P12032 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timp1P12032 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timp1P12032 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Timp1P12032 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timp1P12032 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timp1P12032 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Timp1P12032 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Timp1P12032 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timp1P12032 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timp1P12032 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timp1P12032 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timp1P12032 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timp1P12032 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timp1P12032 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timp1P12032 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timp1P12032 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timp1P12032 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timp1P12032 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Timp1P12032 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Timp1P12032 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Timp1P12032 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timp1P12032 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Timp1P12032 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Timp1P12032 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Timp1P12032 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timp1P12032 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timp1P12032 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Timp1P12032 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timp1P12032 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timp1P12032 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timp1P12032 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timp1P12032 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timp1P12032 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Timp1P12032 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timp1P12032 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timp1P12032 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timp1P12032 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timp1P12032 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timp1P12032 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timp1P12032 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Timp1P12032 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Timp1P12032 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Timp1P12032 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Timp1P12032 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Timp1P12032 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Timp1P12032 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Timp1P12032 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Timp1P12032 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Timp1P12032 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Timp1P12032 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Timp1P12032 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Timp1P12032 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Timp1P12032 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Timp1P12032 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Timp1P12032 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Timp1P12032 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Timp1P12032 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Timp1P12032 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Timp1P12032 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Timp1P12032 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms