Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtcP11725 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtcP11725 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtcP11725 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtcP11725 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtcP11725 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtcP11725 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtcP11725 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtcP11725 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtcP11725 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtcP11725 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtcP11725 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtcP11725 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
OtcP11725 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtcP11725 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
OtcP11725 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtcP11725 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtcP11725 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
OtcP11725 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtcP11725 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtcP11725 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtcP11725 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtcP11725 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
OtcP11725 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtcP11725 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtcP11725 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtcP11725 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtcP11725 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtcP11725 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtcP11725 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtcP11725 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtcP11725 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtcP11725 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtcP11725 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtcP11725 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtcP11725 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtcP11725 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtcP11725 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtcP11725 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtcP11725 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtcP11725 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtcP11725 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
OtcP11725 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtcP11725 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtcP11725 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtcP11725 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtcP11725 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtcP11725 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtcP11725 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtcP11725 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtcP11725 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtcP11725 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtcP11725 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtcP11725 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtcP11725 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtcP11725 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtcP11725 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtcP11725 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtcP11725 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtcP11725 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtcP11725 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtcP11725 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtcP11725 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtcP11725 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtcP11725 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtcP11725 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtcP11725 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtcP11725 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtcP11725 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtcP11725 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtcP11725 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtcP11725 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtcP11725 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtcP11725 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtcP11725 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
OtcP11725 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtcP11725 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtcP11725 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtcP11725 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtcP11725 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
OtcP11725 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtcP11725 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtcP11725 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtcP11725 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtcP11725 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtcP11725 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtcP11725 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtcP11725 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
OtcP11725 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
OtcP11725 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
OtcP11725 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
OtcP11725 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
OtcP11725 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
OtcP11725 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
OtcP11725 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
OtcP11725 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
OtcP11725 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
OtcP11725 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
OtcP11725 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
OtcP11725 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms