Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DmdP11531 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DmdP11531 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DmdP11531 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DmdP11531 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DmdP11531 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DmdP11531 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DmdP11531 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DmdP11531 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DmdP11531 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DmdP11531 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DmdP11531 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DmdP11531 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DmdP11531 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DmdP11531 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DmdP11531 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DmdP11531 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DmdP11531 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DmdP11531 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
DmdP11531 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
DmdP11531 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DmdP11531 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DmdP11531 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DmdP11531 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DmdP11531 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DmdP11531 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DmdP11531 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DmdP11531 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DmdP11531 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DmdP11531 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DmdP11531 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DmdP11531 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DmdP11531 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DmdP11531 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DmdP11531 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DmdP11531 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DmdP11531 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DmdP11531 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DmdP11531 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DmdP11531 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DmdP11531 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DmdP11531 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DmdP11531 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DmdP11531 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DmdP11531 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DmdP11531 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DmdP11531 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DmdP11531 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DmdP11531 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DmdP11531 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DmdP11531 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DmdP11531 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DmdP11531 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DmdP11531 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DmdP11531 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DmdP11531 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DmdP11531 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DmdP11531 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DmdP11531 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DmdP11531 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DmdP11531 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DmdP11531 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DmdP11531 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DmdP11531 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DmdP11531 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DmdP11531 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DmdP11531 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DmdP11531 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DmdP11531 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DmdP11531 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DmdP11531 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DmdP11531 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DmdP11531 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DmdP11531 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DmdP11531 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DmdP11531 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DmdP11531 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DmdP11531 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DmdP11531 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DmdP11531 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DmdP11531 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DmdP11531 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DmdP11531 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DmdP11531 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DmdP11531 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DmdP11531 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DmdP11531 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DmdP11531 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DmdP11531 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DmdP11531 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DmdP11531 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DmdP11531 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DmdP11531 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DmdP11531 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DmdP11531 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DmdP11531 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DmdP11531 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DmdP11531 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DmdP11531 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DmdP11531 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms