Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prf1P10820 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Prf1P10820 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prf1P10820 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prf1P10820 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prf1P10820 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prf1P10820 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prf1P10820 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prf1P10820 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Prf1P10820 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prf1P10820 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prf1P10820 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prf1P10820 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prf1P10820 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prf1P10820 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms