Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P10404 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P10404 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P10404 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P10404 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P10404 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
P10404 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
P10404 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P10404 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P10404 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P10404 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P10404 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P10404 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P10404 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P10404 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P10404 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
P10404 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P10404 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P10404 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P10404 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
P10404 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P10404 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P10404 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P10404 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P10404 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P10404 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P10404 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P10404 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P10404 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P10404 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P10404 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P10404 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P10404 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
P10404 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P10404 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P10404 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P10404 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P10404 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P10404 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P10404 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P10404 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
P10404 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P10404 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P10404 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
P10404 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P10404 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P10404 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P10404 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P10404 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P10404 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P10404 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P10404 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P10404 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P10404 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P10404 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P10404 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P10404 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P10404 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P10404 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P10404 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P10404 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
P10404 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P10404 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P10404 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P10404 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
P10404 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
P10404 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P10404 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P10404 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P10404 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P10404 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P10404 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
P10404 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
P10404 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P10404 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P10404 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
P10404 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
P10404 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P10404 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P10404 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P10404 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P10404 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
P10404 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P10404 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P10404 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P10404 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P10404 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P10404 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P10404 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
P10404 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
P10404 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P10404 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P10404 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
P10404 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
P10404 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P10404 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P10404 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P10404 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P10404 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P10404 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms