Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

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Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PolP10400 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PolP10400 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PolP10400 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PolP10400 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PolP10400 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PolP10400 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PolP10400 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PolP10400 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PolP10400 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PolP10400 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PolP10400 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PolP10400 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PolP10400 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PolP10400 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PolP10400 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PolP10400 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PolP10400 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PolP10400 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PolP10400 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PolP10400 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PolP10400 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PolP10400 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PolP10400 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PolP10400 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PolP10400 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PolP10400 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PolP10400 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PolP10400 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PolP10400 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PolP10400 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PolP10400 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PolP10400 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PolP10400 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PolP10400 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PolP10400 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PolP10400 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PolP10400 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PolP10400 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PolP10400 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PolP10400 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PolP10400 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PolP10400 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PolP10400 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PolP10400 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PolP10400 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PolP10400 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PolP10400 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PolP10400 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PolP10400 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PolP10400 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PolP10400 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PolP10400 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PolP10400 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PolP10400 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PolP10400 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PolP10400 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PolP10400 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PolP10400 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PolP10400 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PolP10400 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PolP10400 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PolP10400 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PolP10400 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PolP10400 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PolP10400 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PolP10400 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PolP10400 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PolP10400 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PolP10400 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PolP10400 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PolP10400 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PolP10400 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PolP10400 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PolP10400 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PolP10400 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PolP10400 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PolP10400 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PolP10400 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PolP10400 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PolP10400 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PolP10400 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PolP10400 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PolP10400 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PolP10400 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PolP10400 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PolP10400 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PolP10400 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PolP10400 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PolP10400 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PolP10400 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PolP10400 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PolP10400 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PolP10400 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PolP10400 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PolP10400 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PolP10400 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PolP10400 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PolP10400 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PolP10400 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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