Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms