Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms