Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa4P06798 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms